哈维氏弧菌是海洋鱼类和无脊椎动物的重要条件致病菌,经常造成海水养殖动物严重病害,给水产养殖业造成巨大的经济损失,而不同来源的哈维氏弧菌的毒力存在很大差异。本研究采用第二代 Illumina Hiseq 平台与第三代 PacBio 平台相结合的测序技术,对分离自福建海域患病青石斑鱼的哈维氏弧菌TS-628菌株进行基因组测序和分析,挖掘该菌的基因组信息,从基因组层面了解该病原菌的毒力相关基因,以期为哈维氏弧菌后续致病机制的研究以及哈维氏弧菌病防治提供有力数据支撑。结果表明,哈维氏弧菌TS-628菌株基因组含2条染色体、2个质粒,其中1个质粒为新发现质粒;基因组大小为6 151 198 bp,基因组GC含量为44.68%,共编码5 658个基因,共预测到毒力基因747个,毒力基因主要与细菌的黏附、摄铁系统及分泌系统有关;此外,还发现耐药基因294个,反映该菌株不仅具有编码多种毒力因子的潜力,同时具有抗多种药物的可能。
